Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GO95257 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GADD45GO95257 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GADD45GO95257 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GADD45GO95257 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GO95257 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms