Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRATO95237 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRATO95237 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRATO95237 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRATO95237 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRATO95237 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRATO95237 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRATO95237 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRATO95237 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRATO95237 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRATO95237 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRATO95237 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRATO95237 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRATO95237 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRATO95237 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRATO95237 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRATO95237 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRATO95237 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRATO95237 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRATO95237 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRATO95237 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRATO95237 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRATO95237 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRATO95237 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRATO95237 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRATO95237 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRATO95237 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRATO95237 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRATO95237 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRATO95237 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRATO95237 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRATO95237 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRATO95237 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRATO95237 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRATO95237 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRATO95237 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRATO95237 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRATO95237 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRATO95237 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRATO95237 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRATO95237 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRATO95237 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRATO95237 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRATO95237 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRATO95237 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRATO95237 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRATO95237 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRATO95237 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRATO95237 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRATO95237 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRATO95237 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRATO95237 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRATO95237 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRATO95237 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRATO95237 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRATO95237 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRATO95237 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRATO95237 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRATO95237 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRATO95237 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRATO95237 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRATO95237 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRATO95237 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRATO95237 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRATO95237 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRATO95237 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRATO95237 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRATO95237 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRATO95237 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRATO95237 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRATO95237 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRATO95237 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRATO95237 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRATO95237 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRATO95237 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRATO95237 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRATO95237 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRATO95237 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRATO95237 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRATO95237 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRATO95237 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRATO95237 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRATO95237 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRATO95237 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRATO95237 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRATO95237 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRATO95237 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRATO95237 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRATO95237 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRATO95237 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRATO95237 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRATO95237 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRATO95237 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRATO95237 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRATO95237 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRATO95237 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRATO95237 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRATO95237 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRATO95237 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRATO95237 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms