Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN3O95197 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN3O95197 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN3O95197 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN3O95197 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN3O95197 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN3O95197 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN3O95197 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN3O95197 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN3O95197 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN3O95197 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN3O95197 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN3O95197 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN3O95197 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN3O95197 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN3O95197 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN3O95197 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN3O95197 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN3O95197 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN3O95197 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN3O95197 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTN3O95197 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN3O95197 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTN3O95197 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN3O95197 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN3O95197 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN3O95197 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN3O95197 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN3O95197 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN3O95197 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN3O95197 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN3O95197 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTN3O95197 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN3O95197 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTN3O95197 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTN3O95197 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTN3O95197 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN3O95197 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN3O95197 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN3O95197 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN3O95197 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN3O95197 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN3O95197 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN3O95197 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN3O95197 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTN3O95197 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTN3O95197 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN3O95197 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN3O95197 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN3O95197 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN3O95197 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN3O95197 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN3O95197 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN3O95197 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN3O95197 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN3O95197 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN3O95197 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN3O95197 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN3O95197 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN3O95197 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN3O95197 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN3O95197 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN3O95197 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN3O95197 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN3O95197 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN3O95197 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN3O95197 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN3O95197 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN3O95197 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN3O95197 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN3O95197 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN3O95197 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN3O95197 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN3O95197 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN3O95197 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN3O95197 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN3O95197 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN3O95197 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN3O95197 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN3O95197 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN3O95197 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN3O95197 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN3O95197 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN3O95197 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN3O95197 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN3O95197 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN3O95197 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN3O95197 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN3O95197 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN3O95197 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN3O95197 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN3O95197 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN3O95197 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms