Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFASCO94856 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFASCO94856 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFASCO94856 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFASCO94856 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFASCO94856 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFASCO94856 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFASCO94856 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFASCO94856 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFASCO94856 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFASCO94856 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFASCO94856 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFASCO94856 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFASCO94856 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFASCO94856 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFASCO94856 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFASCO94856 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NFASCO94856 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NFASCO94856 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFASCO94856 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFASCO94856 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFASCO94856 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFASCO94856 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFASCO94856 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFASCO94856 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NFASCO94856 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFASCO94856 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFASCO94856 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFASCO94856 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFASCO94856 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFASCO94856 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFASCO94856 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFASCO94856 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFASCO94856 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFASCO94856 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFASCO94856 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFASCO94856 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFASCO94856 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NFASCO94856 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NFASCO94856 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFASCO94856 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NFASCO94856 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NFASCO94856 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFASCO94856 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFASCO94856 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFASCO94856 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFASCO94856 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFASCO94856 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFASCO94856 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFASCO94856 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFASCO94856 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NFASCO94856 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFASCO94856 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFASCO94856 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFASCO94856 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NFASCO94856 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFASCO94856 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFASCO94856 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFASCO94856 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFASCO94856 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFASCO94856 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFASCO94856 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFASCO94856 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFASCO94856 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFASCO94856 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFASCO94856 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFASCO94856 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFASCO94856 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFASCO94856 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFASCO94856 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFASCO94856 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFASCO94856 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFASCO94856 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFASCO94856 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFASCO94856 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFASCO94856 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFASCO94856 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFASCO94856 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFASCO94856 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NFASCO94856 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFASCO94856 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFASCO94856 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFASCO94856 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFASCO94856 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFASCO94856 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFASCO94856 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFASCO94856 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFASCO94856 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFASCO94856 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFASCO94856 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFASCO94856 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFASCO94856 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFASCO94856 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NFASCO94856 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFASCO94856 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFASCO94856 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFASCO94856 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFASCO94856 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NFASCO94856 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NFASCO94856 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms