Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTL6BO94805 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTL6BO94805 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTL6BO94805 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTL6BO94805 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTL6BO94805 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6BO94805 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6BO94805 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTL6BO94805 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6BO94805 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6BO94805 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTL6BO94805 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTL6BO94805 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6BO94805 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6BO94805 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6BO94805 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6BO94805 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6BO94805 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTL6BO94805 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6BO94805 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6BO94805 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6BO94805 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTL6BO94805 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6BO94805 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6BO94805 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6BO94805 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6BO94805 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6BO94805 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTL6BO94805 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACTL6BO94805 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTL6BO94805 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms