Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP1O94782 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP1O94782 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP1O94782 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP1O94782 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP1O94782 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP1O94782 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP1O94782 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP1O94782 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP1O94782 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP1O94782 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP1O94782 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP1O94782 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP1O94782 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP1O94782 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP1O94782 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP1O94782 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP1O94782 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP1O94782 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP1O94782 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP1O94782 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP1O94782 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP1O94782 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP1O94782 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP1O94782 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP1O94782 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP1O94782 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP1O94782 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP1O94782 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP1O94782 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP1O94782 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP1O94782 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP1O94782 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP1O94782 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP1O94782 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP1O94782 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP1O94782 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP1O94782 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP1O94782 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
USP1O94782 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP1O94782 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP1O94782 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP1O94782 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP1O94782 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP1O94782 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP1O94782 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP1O94782 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP1O94782 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP1O94782 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP1O94782 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP1O94782 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP1O94782 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP1O94782 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP1O94782 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP1O94782 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP1O94782 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP1O94782 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP1O94782 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP1O94782 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP1O94782 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP1O94782 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP1O94782 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP1O94782 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP1O94782 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP1O94782 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP1O94782 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP1O94782 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP1O94782 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP1O94782 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP1O94782 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP1O94782 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP1O94782 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP1O94782 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP1O94782 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP1O94782 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP1O94782 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP1O94782 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP1O94782 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP1O94782 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP1O94782 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP1O94782 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP1O94782 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP1O94782 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP1O94782 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP1O94782 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP1O94782 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP1O94782 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP1O94782 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP1O94782 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP1O94782 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP1O94782 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP1O94782 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP1O94782 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP1O94782 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP1O94782 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP1O94782 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP1O94782 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP1O94782 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP1O94782 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP1O94782 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms