Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCGO76070 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCGO76070 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCGO76070 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNCGO76070 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCGO76070 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCGO76070 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCGO76070 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCGO76070 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNCGO76070 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCGO76070 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNCGO76070 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCGO76070 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCGO76070 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCGO76070 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCGO76070 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNCGO76070 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNCGO76070 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNCGO76070 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCGO76070 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCGO76070 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCGO76070 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCGO76070 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCGO76070 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCGO76070 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCGO76070 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCGO76070 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCGO76070 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCGO76070 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCGO76070 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCGO76070 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCGO76070 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCGO76070 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCGO76070 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCGO76070 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCGO76070 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCGO76070 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNCGO76070 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCGO76070 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCGO76070 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCGO76070 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCGO76070 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCGO76070 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNCGO76070 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCGO76070 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCGO76070 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNCGO76070 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNCGO76070 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCGO76070 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCGO76070 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCGO76070 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCGO76070 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCGO76070 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCGO76070 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCGO76070 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCGO76070 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCGO76070 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCGO76070 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCGO76070 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCGO76070 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCGO76070 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCGO76070 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCGO76070 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCGO76070 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCGO76070 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCGO76070 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCGO76070 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNCGO76070 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCGO76070 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCGO76070 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNCGO76070 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCGO76070 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNCGO76070 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNCGO76070 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCGO76070 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCGO76070 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCGO76070 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNCGO76070 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCGO76070 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCGO76070 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCGO76070 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCGO76070 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCGO76070 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCGO76070 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCGO76070 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCGO76070 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCGO76070 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCGO76070 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCGO76070 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCGO76070 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCGO76070 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCGO76070 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCGO76070 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms