Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN9O75954 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN9O75954 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN9O75954 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN9O75954 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN9O75954 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms