Protein–RNA interactions for Protein: O75718

CRTAP, Cartilage-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAPO75718 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAPO75718 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRTAPO75718 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRTAPO75718 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRTAPO75718 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRTAPO75718 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAPO75718 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms