Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA10O75578 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA10O75578 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA10O75578 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA10O75578 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA10O75578 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms