Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA2O75334 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA2O75334 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA2O75334 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA2O75334 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA2O75334 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA2O75334 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA2O75334 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA2O75334 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA2O75334 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA2O75334 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA2O75334 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA2O75334 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA2O75334 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA2O75334 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA2O75334 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA2O75334 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA2O75334 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA2O75334 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms