Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX11AO75192 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX11AO75192 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX11AO75192 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PEX11AO75192 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PEX11AO75192 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX11AO75192 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX11AO75192 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms