Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IGSF3O75054 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IGSF3O75054 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
IGSF3O75054 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
IGSF3O75054 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
IGSF3O75054 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms