Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNASEH1O60930 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNASEH1O60930 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNASEH1O60930 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNASEH1O60930 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNASEH1O60930 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNASEH1O60930 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNASEH1O60930 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNASEH1O60930 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNASEH1O60930 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms