Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUBNO60494 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUBNO60494 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUBNO60494 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUBNO60494 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUBNO60494 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CUBNO60494 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUBNO60494 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUBNO60494 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUBNO60494 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CUBNO60494 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUBNO60494 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUBNO60494 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUBNO60494 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUBNO60494 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUBNO60494 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CUBNO60494 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUBNO60494 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUBNO60494 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUBNO60494 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUBNO60494 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUBNO60494 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUBNO60494 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUBNO60494 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUBNO60494 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUBNO60494 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUBNO60494 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUBNO60494 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUBNO60494 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUBNO60494 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUBNO60494 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUBNO60494 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUBNO60494 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUBNO60494 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUBNO60494 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUBNO60494 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUBNO60494 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUBNO60494 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUBNO60494 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUBNO60494 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUBNO60494 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUBNO60494 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUBNO60494 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUBNO60494 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUBNO60494 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUBNO60494 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUBNO60494 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUBNO60494 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUBNO60494 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUBNO60494 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUBNO60494 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUBNO60494 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUBNO60494 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUBNO60494 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUBNO60494 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUBNO60494 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUBNO60494 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUBNO60494 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CUBNO60494 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUBNO60494 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUBNO60494 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUBNO60494 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUBNO60494 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUBNO60494 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUBNO60494 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUBNO60494 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUBNO60494 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUBNO60494 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUBNO60494 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUBNO60494 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUBNO60494 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUBNO60494 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUBNO60494 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUBNO60494 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUBNO60494 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUBNO60494 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUBNO60494 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUBNO60494 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUBNO60494 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CUBNO60494 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUBNO60494 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CUBNO60494 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CUBNO60494 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUBNO60494 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUBNO60494 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUBNO60494 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUBNO60494 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUBNO60494 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUBNO60494 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUBNO60494 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUBNO60494 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms