Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HTRA2O43464 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HTRA2O43464 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTRA2O43464 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA2O43464 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTRA2O43464 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTRA2O43464 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTRA2O43464 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms