Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MEFVO15553 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MEFVO15553 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MEFVO15553 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MEFVO15553 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEFVO15553 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEFVO15553 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEFVO15553 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MEFVO15553 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEFVO15553 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MEFVO15553 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEFVO15553 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEFVO15553 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MEFVO15553 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEFVO15553 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEFVO15553 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MEFVO15553 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEFVO15553 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEFVO15553 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEFVO15553 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEFVO15553 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEFVO15553 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEFVO15553 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEFVO15553 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEFVO15553 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEFVO15553 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MEFVO15553 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEFVO15553 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEFVO15553 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEFVO15553 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEFVO15553 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEFVO15553 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEFVO15553 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEFVO15553 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEFVO15553 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEFVO15553 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEFVO15553 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEFVO15553 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEFVO15553 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEFVO15553 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEFVO15553 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEFVO15553 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEFVO15553 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEFVO15553 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MEFVO15553 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEFVO15553 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEFVO15553 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEFVO15553 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEFVO15553 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEFVO15553 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEFVO15553 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEFVO15553 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEFVO15553 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEFVO15553 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEFVO15553 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEFVO15553 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEFVO15553 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEFVO15553 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEFVO15553 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEFVO15553 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEFVO15553 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEFVO15553 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEFVO15553 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEFVO15553 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEFVO15553 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEFVO15553 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEFVO15553 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEFVO15553 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEFVO15553 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEFVO15553 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEFVO15553 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEFVO15553 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MEFVO15553 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEFVO15553 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEFVO15553 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEFVO15553 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEFVO15553 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEFVO15553 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEFVO15553 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEFVO15553 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEFVO15553 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEFVO15553 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEFVO15553 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEFVO15553 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEFVO15553 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEFVO15553 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEFVO15553 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MEFVO15553 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEFVO15553 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEFVO15553 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MEFVO15553 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEFVO15553 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MEFVO15553 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEFVO15553 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MEFVO15553 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEFVO15553 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEFVO15553 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEFVO15553 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEFVO15553 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MEFVO15553 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms