Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOXO15266 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOXO15266 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOXO15266 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOXO15266 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOXO15266 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOXO15266 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOXO15266 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOXO15266 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOXO15266 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOXO15266 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOXO15266 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOXO15266 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOXO15266 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOXO15266 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOXO15266 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOXO15266 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOXO15266 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOXO15266 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOXO15266 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOXO15266 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOXO15266 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOXO15266 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOXO15266 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOXO15266 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOXO15266 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOXO15266 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOXO15266 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOXO15266 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOXO15266 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOXO15266 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOXO15266 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOXO15266 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOXO15266 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOXO15266 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOXO15266 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOXO15266 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHOXO15266 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOXO15266 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOXO15266 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOXO15266 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHOXO15266 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHOXO15266 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHOXO15266 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOXO15266 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOXO15266 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOXO15266 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOXO15266 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHOXO15266 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHOXO15266 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOXO15266 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOXO15266 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHOXO15266 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHOXO15266 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHOXO15266 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOXO15266 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOXO15266 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOXO15266 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOXO15266 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHOXO15266 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOXO15266 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHOXO15266 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOXO15266 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOXO15266 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOXO15266 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOXO15266 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOXO15266 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOXO15266 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOXO15266 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOXO15266 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOXO15266 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOXO15266 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOXO15266 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOXO15266 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOXO15266 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOXO15266 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOXO15266 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOXO15266 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOXO15266 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOXO15266 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOXO15266 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOXO15266 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOXO15266 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOXO15266 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOXO15266 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOXO15266 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms