Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF4O15260 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF4O15260 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF4O15260 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF4O15260 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SURF4O15260 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SURF4O15260 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SURF4O15260 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF4O15260 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF4O15260 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF4O15260 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF4O15260 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF4O15260 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF4O15260 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF4O15260 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF4O15260 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF4O15260 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF4O15260 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF4O15260 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF4O15260 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF4O15260 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF4O15260 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF4O15260 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF4O15260 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF4O15260 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF4O15260 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF4O15260 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF4O15260 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF4O15260 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF4O15260 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF4O15260 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF4O15260 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF4O15260 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF4O15260 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF4O15260 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SURF4O15260 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SURF4O15260 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF4O15260 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF4O15260 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SURF4O15260 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF4O15260 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF4O15260 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF4O15260 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SURF4O15260 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SURF4O15260 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SURF4O15260 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SURF4O15260 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF4O15260 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SURF4O15260 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SURF4O15260 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF4O15260 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF4O15260 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF4O15260 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SURF4O15260 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF4O15260 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SURF4O15260 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SURF4O15260 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SURF4O15260 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SURF4O15260 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF4O15260 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF4O15260 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SURF4O15260 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SURF4O15260 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SURF4O15260 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF4O15260 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SURF4O15260 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF4O15260 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF4O15260 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF4O15260 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF4O15260 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF4O15260 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF4O15260 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF4O15260 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF4O15260 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF4O15260 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF4O15260 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF4O15260 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF4O15260 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF4O15260 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF4O15260 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF4O15260 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF4O15260 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF4O15260 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF4O15260 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF4O15260 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF4O15260 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms