Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A1O15245 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A1O15245 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC22A1O15245 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A1O15245 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A1O15245 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A1O15245 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms