Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
SYNJ2O15056 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
SYNJ2O15056 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SYNJ2O15056 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
SYNJ2O15056 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SYNJ2O15056 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
SYNJ2O15056 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
SYNJ2O15056 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SYNJ2O15056 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SYNJ2O15056 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
SYNJ2O15056 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
SYNJ2O15056 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.68■■■■■ 4.74
SYNJ2O15056 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SYNJ2O15056 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
SYNJ2O15056 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SYNJ2O15056 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SYNJ2O15056 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SYNJ2O15056 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
SYNJ2O15056 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
SYNJ2O15056 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.46■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SYNJ2O15056 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
SYNJ2O15056 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
SYNJ2O15056 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
SYNJ2O15056 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SYNJ2O15056 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
SYNJ2O15056 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SYNJ2O15056 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
SYNJ2O15056 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
SYNJ2O15056 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SYNJ2O15056 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms