Protein–RNA interactions for Protein: O14718

RRH, Visual pigment-like receptor peropsin, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRHO14718 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRHO14718 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRHO14718 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRHO14718 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRHO14718 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRHO14718 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRHO14718 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRHO14718 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRHO14718 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRHO14718 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRHO14718 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRHO14718 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRHO14718 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRHO14718 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRHO14718 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRHO14718 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRHO14718 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRHO14718 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRHO14718 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRHO14718 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRHO14718 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRHO14718 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRHO14718 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRHO14718 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRHO14718 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRHO14718 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRHO14718 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRHO14718 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRHO14718 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRHO14718 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRHO14718 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRHO14718 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRHO14718 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRHO14718 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRHO14718 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRHO14718 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRHO14718 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRHO14718 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRHO14718 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRHO14718 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRHO14718 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRHO14718 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRHO14718 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRHO14718 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRHO14718 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRHO14718 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRHO14718 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRHO14718 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRHO14718 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRHO14718 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRHO14718 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RRHO14718 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRHO14718 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRHO14718 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRHO14718 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRHO14718 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRHO14718 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRHO14718 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRHO14718 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRHO14718 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRHO14718 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRHO14718 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRHO14718 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRHO14718 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRHO14718 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRHO14718 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRHO14718 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRHO14718 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRHO14718 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRHO14718 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRHO14718 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRHO14718 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRHO14718 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRHO14718 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRHO14718 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRHO14718 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRHO14718 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRHO14718 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRHO14718 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRHO14718 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRHO14718 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRHO14718 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRHO14718 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRHO14718 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRHO14718 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRHO14718 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRHO14718 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRHO14718 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRHO14718 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRHO14718 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRHO14718 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRHO14718 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRHO14718 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RRHO14718 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRHO14718 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRHO14718 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRHO14718 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRHO14718 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRHO14718 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRHO14718 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms