Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN4O14493 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN4O14493 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN4O14493 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN4O14493 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN4O14493 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN4O14493 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms