Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRIT1O00522 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRIT1O00522 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRIT1O00522 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRIT1O00522 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRIT1O00522 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRIT1O00522 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms