Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ELL2O00472 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ELL2O00472 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ELL2O00472 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ELL2O00472 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ELL2O00472 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ELL2O00472 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ELL2O00472 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ELL2O00472 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ELL2O00472 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ELL2O00472 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ELL2O00472 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ELL2O00472 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ELL2O00472 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ELL2O00472 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ELL2O00472 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ELL2O00472 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ELL2O00472 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ELL2O00472 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ELL2O00472 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ELL2O00472 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ELL2O00472 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ELL2O00472 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ELL2O00472 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ELL2O00472 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ELL2O00472 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ELL2O00472 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ELL2O00472 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ELL2O00472 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ELL2O00472 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ELL2O00472 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ELL2O00472 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ELL2O00472 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ELL2O00472 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ELL2O00472 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ELL2O00472 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ELL2O00472 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ELL2O00472 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ELL2O00472 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ELL2O00472 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ELL2O00472 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ELL2O00472 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ELL2O00472 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ELL2O00472 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ELL2O00472 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ELL2O00472 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ELL2O00472 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ELL2O00472 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ELL2O00472 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ELL2O00472 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ELL2O00472 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ELL2O00472 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ELL2O00472 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ELL2O00472 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ELL2O00472 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ELL2O00472 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ELL2O00472 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ELL2O00472 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ELL2O00472 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ELL2O00472 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ELL2O00472 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ELL2O00472 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ELL2O00472 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ELL2O00472 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ELL2O00472 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ELL2O00472 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ELL2O00472 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ELL2O00472 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ELL2O00472 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ELL2O00472 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ELL2O00472 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ELL2O00472 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ELL2O00472 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ELL2O00472 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ELL2O00472 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ELL2O00472 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ELL2O00472 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ELL2O00472 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ELL2O00472 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ELL2O00472 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ELL2O00472 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ELL2O00472 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ELL2O00472 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ELL2O00472 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ELL2O00472 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ELL2O00472 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ELL2O00472 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ELL2O00472 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ELL2O00472 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ELL2O00472 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ELL2O00472 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ELL2O00472 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ELL2O00472 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ELL2O00472 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ELL2O00472 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ELL2O00472 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ELL2O00472 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ELL2O00472 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ELL2O00472 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ELL2O00472 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms