Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPH6UMI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPH6UMI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPH6UMI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABARAPH6UMI1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPH6UMI1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms