Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC179H3BU77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC179H3BU77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC179H3BU77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC179H3BU77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC179H3BU77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms