Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPB6E9PJ23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB6E9PJ23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB6E9PJ23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB6E9PJ23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB6E9PJ23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms