Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NACAE9PAV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NACAE9PAV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NACAE9PAV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NACAE9PAV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NACAE9PAV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NACAE9PAV3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NACAE9PAV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NACAE9PAV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NACAE9PAV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NACAE9PAV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NACAE9PAV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms