Protein–RNA interactions for Protein: C9JVG2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JVG2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9JVG2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9JVG2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9JVG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9JVG2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9JVG2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9JVG2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9JVG2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9JVG2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9JVG2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9JVG2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9JVG2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9JVG2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9JVG2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C9JVG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9JVG2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9JVG2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9JVG2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9JVG2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9JVG2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9JVG2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9JVG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9JVG2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9JVG2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9JVG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9JVG2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9JVG2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9JVG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9JVG2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9JVG2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C9JVG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9JVG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9JVG2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9JVG2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9JVG2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9JVG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9JVG2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9JVG2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9JVG2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9JVG2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9JVG2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9JVG2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9JVG2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9JVG2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9JVG2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9JVG2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9JVG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9JVG2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9JVG2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9JVG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9JVG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9JVG2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9JVG2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9JVG2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9JVG2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9JVG2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9JVG2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9JVG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9JVG2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9JVG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9JVG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9JVG2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9JVG2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9JVG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9JVG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9JVG2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9JVG2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9JVG2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9JVG2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C9JVG2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9JVG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9JVG2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9JVG2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9JVG2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9JVG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9JVG2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9JVG2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C9JVG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9JVG2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9JVG2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9JVG2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9JVG2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9JVG2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9JVG2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9JVG2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9JVG2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9JVG2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9JVG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9JVG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9JVG2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9JVG2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9JVG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9JVG2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms