Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
KRTAP9-6A8MVA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-6A8MVA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms