Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOTOA8MTQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOTOA8MTQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NOTOA8MTQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOTOA8MTQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOTOA8MTQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms