Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ88

SAGE2P, Putative SAGE1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE2PA6NJ88 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAGE2PA6NJ88 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SAGE2PA6NJ88 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAGE2PA6NJ88 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAGE2PA6NJ88 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAGE2PA6NJ88 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAGE2PA6NJ88 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms