Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM64A6NGJ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM64A6NGJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM64A6NGJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM64A6NGJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM64A6NGJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM64A6NGJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms