Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA6L9A6NEM1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6L9A6NEM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6L9A6NEM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L9A6NEM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L9A6NEM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms