Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XIRP2A4UGR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP2A4UGR9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP2A4UGR9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
XIRP2A4UGR9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP2A4UGR9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XIRP2A4UGR9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XIRP2A4UGR9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
XIRP2A4UGR9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms