Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SBNO1A3KN83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SBNO1A3KN83 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SBNO1A3KN83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SBNO1A3KN83 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SBNO1A3KN83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SBNO1A3KN83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBNO1A3KN83 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SBNO1A3KN83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SBNO1A3KN83 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SBNO1A3KN83 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SBNO1A3KN83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SBNO1A3KN83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SBNO1A3KN83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SBNO1A3KN83 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SBNO1A3KN83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms