Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCE3A1L190 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYCE3A1L190 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCE3A1L190 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCE3A1L190 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCE3A1L190 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCE3A1L190 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCE3A1L190 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms