Protein–RNA interactions for Protein: A0PK00

TMEM120B, Transmembrane protein 120B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM120BA0PK00 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM120BA0PK00 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM120BA0PK00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM120BA0PK00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM120BA0PK00 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM120BA0PK00 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM120BA0PK00 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM120BA0PK00 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM120BA0PK00 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM120BA0PK00 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM120BA0PK00 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM120BA0PK00 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM120BA0PK00 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms