Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ09

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ09 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQ09 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PQ09 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQ09 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PQ09 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PQ09 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms