Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J272

TRAV24, T-cell receptor alpha variable 24 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV24A0A0B4J272 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV24A0A0B4J272 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV24A0A0B4J272 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAV24A0A0B4J272 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV24A0A0B4J272 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV24A0A0B4J272 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV24A0A0B4J272 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAV24A0A0B4J272 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV24A0A0B4J272 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV24A0A0B4J272 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV24A0A0B4J272 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV24A0A0B4J272 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV24A0A0B4J272 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms