Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A087WVE0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A087WVE0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A087WVE0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms