Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1-27A0A075B6S5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-27A0A075B6S5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1-27A0A075B6S5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-27A0A075B6S5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms