Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 CDK1-207ENST00000519078 723 ntTSL 37.51□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 KHSRP-204ENST00000595112 745 ntTSL 317.02■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 AURKAIP1-205ENST00000489799 695 ntTSL 1 (best)25.99■■□□□ 1.752e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 AURKAIP1-206ENST00000496905 608 ntTSL 219.27■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-214ENST00000641314 1558 nt19.03■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-230ENST00000641927 1678 nt18.88■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-227ENST00000641811 1031 nt18.55■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-201ENST00000369407 3180 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 25.6
UTP3Q9NQZ2 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.248e-8■■■■□ 25.5
UTP3Q9NQZ2 ENO1-206ENST00000497492 647 ntTSL 213.1□□□□□ -0.318e-8■■■■□ 25.5
UTP3Q9NQZ2 ENO1-203ENST00000486051 536 ntTSL 36.89□□□□□ -1.318e-8■■■■□ 25.5
UTP3Q9NQZ2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 25.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.652e-6■■■■□ 25.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.512e-6■■■■□ 25.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 224.38■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 25.5
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 410.62□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 49.79□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 29.13□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.3□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.05□□□□□ -1.121e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.62□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 ACO2-203ENST00000466237 747 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.883e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.493e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.43e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM161B-AS1-211ENST00000512724 570 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 513.93□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 UBR5-206ENST00000519528 325 ntTSL 310.61□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 315.33■□□□□ 0.047e-7■■■■□ 25.4
UTP3Q9NQZ2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 315.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.543e-7■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 423.1■■□□□ 1.292e-9■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-207ENST00000591561 756 ntTSL 35.94□□□□□ -1.465e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 SEC61A1-201ENST00000243253 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 SEC61A1-205ENST00000483956 3046 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 SEC61A1-202ENST00000424880 3238 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 DHX36-210ENST00000481941 2612 ntTSL 26.29□□□□□ -1.46e-7■■■■□ 25.3
UTP3Q9NQZ2 VAPA-204ENST00000577901 917 ntTSL 216.97■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.972e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.972e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 317.07■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-8■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-8■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-8■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-8■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-8■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-8■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 DCTN1-224ENST00000495895 503 ntTSL 210.27□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 ANXA11-207ENST00000463340 377 ntTSL 35.91□□□□□ -1.462e-8■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.467e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 HSPB11-206ENST00000489675 879 ntTSL 27.78□□□□□ -1.167e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 CD164-209ENST00000512212 590 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-217ENST00000550520 753 ntTSL 311.74□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-216ENST00000550192 734 ntTSL 410.36□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 39.03□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-220ENST00000550910 449 ntTSL 37.43□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-224ENST00000552980 527 ntTSL 36.05□□□□□ -1.441e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 KRT19-202ENST00000455635 641 ntTSL 320.23■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 25.2
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-206ENST00000506477 664 ntTSL 217.88■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-205ENST00000505110 518 ntTSL 415.74■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-204ENST00000504902 887 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-208ENST00000507115 663 ntTSL 310.45□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 OGT-208ENST00000472270 689 ntTSL 28.84□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 EIF3A-202ENST00000462527 1192 ntTSL 210.7□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 XPO1-212ENST00000457483 488 ntTSL 47.62□□□□□ -1.199e-8■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 SEC24C-207ENST00000635550 3424 ntTSL 28□□□□□ -1.133e-9■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.258e-7■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-206ENST00000558290 1049 ntTSL 518.27■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-210ENST00000558853 624 ntTSL 316.58■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-218ENST00000559999 529 ntTSL 415.58■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 KIF2C-205ENST00000455186 908 ntTSL 511.01□□□□□ -0.656e-7■■■■□ 25.1
UTP3Q9NQZ2 DEK-207ENST00000515742 661 ntTSL 224.81■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-7■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-7■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 316.53■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 TMED5-203ENST00000370290 3847 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 TMED5-204ENST00000479918 1296 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.572e-7■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 25
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