Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQK5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQK5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U3KQK5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
U3KQK5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQK5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQK5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms