Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHLDA3Q9Y5J5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms