Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES2Q9Y543 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms