Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DTX4Q9Y2E6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms