Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SATB2Q9UPW6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SATB2Q9UPW6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms