Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX12Q9UMY4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms